Search results for "évolution expérimentale"
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Le partage des tâches favorise la coexistence dans les communautés bactériennes dégradant l’atrazine
2019
National audience; Les communautés microbiennes exercent un rôle primordial dans la dégradation des xénobiotiques1, et en particulier des pesticides. Dans le cas de l’herbicide atrazine, plusieurs études ont démontré que sa dégradation faisait intervenir un consortium, plutôt qu’une espèce isolée2,3,4. Cependant, on ne sait pas comment la mise en place de ces consortiums dégradants se fait dans la nature. La théorie de la Reine Noire formalise les conditions nécessaires pour le mise en place de dépendance entre espèces5 : un membre de la communauté, appelé « helper », fournit un bien commun à la communauté par la dégradation d’un composé complexe, alors que les autres, appelés « beneficiari…
Effet de la diversité génétique sur l’efficacité de la sélection artificielle au niveau de la communauté : comment sélectionner des communautés micro…
2019
National audience; La sélection artificielle, à l’origine des espèces animales et végétales d’intérêt agronomique, est classiquement exercée au niveau de l’individu, voire des gènes. Cependant, appliquer cette sélection au niveau supra-individuel permet l’accès à des sources de variation phénotypique supplémentaires introduites par les interactions inter-individuelles. Dans les procédures de sélection artificielle au niveau des communautés, comme dans les procédures classiques, la diversité tend à s’éroder au cours du temps ce qui peut altérer l’efficacité de la sélection. L’objectif de ma thèse est de déterminer comment la diversité génétique influence l’efficacité de la sélection artifici…
Sélection artificielle de communautés microbiennes : effet de la diversité génétique et rôle des interactions interspécifiques
2021
National audience; La sélection artificielle, à l'origine des espèces animales et végétales utilisées en agriculture, alongtemps été appliquée à l’échelle de l’individu. Il est possible de transposer cette procéduresur des holobiontes, communautés ou écosystèmes ; toutefois, cela ajoute un niveau decomplexité puisque le phénotype cible de la sélection résulte de la présence de plusieurs espèceset, potentiellement, de leurs interactions. L'ambition de ce projet est i) de déterminer si unediversité génétique microbienne élevée permet d'améliorer l'efficacité de la sélection artificiellede communautés microbiennes et ii) de déterminer si les interactions entre espèces sontimpliquées dans la mi…
Evolution expérimentale
2016
EA SPE GESTAD BIOME; L'évolution expérimentale consiste à tenter de mener en laboratoire le processus d’évolution afin d’en étudier les règles de fonctionnement sous-jacentes. Les sources de variation dans la réponse sont analysées au cours d’expériences exécutées et répliquées en conditions contrôlées. Cette approche dynamique de l’évolution complète les études habituelles analysant l’évolution a posteriori au moyen de méthodes comparatives ou en étudiant des fossiles. Elle constitue également un pont entre les études conduites dans les conditions naturelles et les simulations réalisées par modélisation mathématique.
Etude de l'évolution du potentiel génétique de populations bactériennes dégradant l'atrazine
2011
Atrazine, one of the most used herbicide to control the development of weeds in crop, has led to the contamination of the environment. Repeated exposure to this herbicide resulted in the emergence of microbial populations able to degrade atrazine and to use it as a nitrogen source for its growth. These microbial populations are responsible for accelerated biodegradation of atrazine (BDA), a key ecosystemic service diminishing the persistence of this herbicide in the environment. The aim of this PhD work was to study genetic and physiological mechanisms responsible for functioning and improving of this ecosystemic service. We applied an experimental approach starting from genes to communitie…